只有阴阳双方维持着动态平衡状态，才能使人的精神活动正常，所谓“阴平阳秘，精神乃治”。所以阴阳与睡眠息息相关，渗透到中医理论的各个方面。人体阴阳消长的变化，决定了睡眠和觉醒的生理活动。自然界的阴阳变化，有其节律，人体阴阳消长与其相应，也有明显的节律。天地阴阳的盛衰消长，致使一天有昼夜晨昏的节律变化。医学`教育网搜集整理人与自然界是统一的整体，人体的阳气，随气有消长出入的日节律运动。平旦时人体的阳气随自然界阴气生发而由里出外，阳气渐长，人起床活动，中午时分人体阳气盛于外部，黄昏则阳气渐消，入夜则阳气潜藏于内，人上床休息。阳入于阴则寐，阳出于阴则寤。阴主静，阳主动；阳气衰，阴气盛，则睡眠；阳气盛，阴气衰，则产生觉醒。这种阴阳盛衰主导睡眠和觉醒的机制，是由于人体阳气入里出表的运动来决定的。在正常情况下，人的阴阳调和，血脉通利，故昼精而夜寐，夜晚有充足高质量的睡眠，体力和精力得以恢复，白天精力充沛，思维敏捷。
科学研究也提供了人体的阴阳日节律的相关论证，以内分泌来说，即表现出阴阳日节律的变化，如人体甲状腺素、促肾上腺皮质激素、糖皮质激素、肾素、醛固酮、促性腺激素、睾酮等等白天分泌增加，夜间分泌降低；而甲状旁腺素、肾上腺皮质激素、生长激素、血管升压素等夜间分泌增加，白天分泌下降。
现代睡眠学认为，睡眠与觉醒系统作用下，要使睡眠得以发生，力量相对较强的觉醒系统的活动应首先减弱，力量相对较弱的睡眠系统充分发挥作用，以致进入睡眠。觉醒系统活动过强，或睡眠系统力量不足，则不能发生睡眠。觉醒系统活动增加，睡眠系统用作减弱，人就觉醒了。这种理论，与阴阳睡眠学说如出一辙，觉醒系统比类为阳，睡眠系统比类为阴，阴阳相互矛盾，相互斗争，又相互依存，相互协调，共同来完成睡眠与觉醒的生理活动，这与阴阳理论异曲同工。可以说阴阳失调是睡眠障碍发病的重要病机。
