疾病与健康是相对而言。人体脏腑、经络的生理活动正常，气血阴阳协调平衡，即所谓"阴平阳秘"。当人体在某种致病因素的作用下，人体脏腑、经络等生理活动异常，气血阴阳平衡协调关系受到破坏，导致"阴阳失调"，出现了各种临床症状，便发生了疾病。中医学认为，疾病的发生和变化，虽然错综复杂，但总其大要，不外关系到人体本身的正气和邪气两个方面。
正气，是指人体的机能活动(包括脏腑、经络、气血等功能)和抗病、康复能力，简称为"正"。所谓邪气，则泛指各种致病因素，简称为"邪"。疾病的发生和变化，即是在一定条件下邪正斗争的反映。
一、正气不足是疾病发生的内在根据
中医发病学很重视人体的正气，认为内脏功能正常，正气旺盛，气血充盈，卫外固密，病邪难于侵入，疾病无从发生，《素问》说："正气存内，邪不可干。"只有在人体正气相对虚弱，卫外不固，抗邪无力的情况下，邪气方能乘虚而入，使人体阴阳失调，脏腑经络功能紊乱，才能发生疾病，《素问》说："邪之所凑，其气必虚。"故说，正气不足是疾病发生的内在根据。
二、邪气是发病的重要条件
中医学重视正气，强调正气在发病中的主导地位，并不排除邪气对疾病发生的重要作用。邪气是发病的条件，在一定的条件下，甚至可能起主导作用。如高温、高压电流、化学毒剂、枪弹伤、冻伤、毒蛇咬伤等，即使正气强盛，也难免被伤害。又如疫疠之邪， "五疫之至，留相染易，无问大小，病状相似"（《素问》），这说明了多种传染病的发生，对人体有较大的危害。
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三、正邪斗争的胜负，决定发病与不发病
正邪斗争，是指正气与病邪的斗争。这种斗争不仅关系着疾病的发生，而且影响疾病的发展及转归。
正能胜邪则不发病 邪气侵袭人体时，正气即起来抗邪，若正气强盛，抗邪有力，则病邪难于侵入，或侵入后即被正气及时消除，不产生病理反应，即不发病。如自然界中经常存在着各种各样的致病因素，但并不是所有接触的人都会发病，此即是正能胜邪的结果。
邪胜正负则发病 在正邪斗争过程中，若邪气偏胜，正气相对不足，邪胜正负，从而使脏腑阴阳气血失调，气机逆乱，便可导致疾病的发生。
发病以后，由于正气强弱的差异、病邪性质的不同和感邪的轻重，以及所在部位的浅深，从而产生不同的病证。如：
疾病与正气强弱的关系：正气强，邪正斗争剧烈，多表现为实证；正气虚弱，抗邪无力，多表现为虚证，或虚实错杂证。
疾病与感邪性质的关系：一般来说，感受阳邪，易导致阳偏盛而伤阴，出现实热证；感受阴邪，易导致阴偏盛而伤阳的寒实证或寒湿证。
疾病与感邪轻重的关系：邪气是导致疾病发生的重要条件，疾病的轻重，除体质因素外，决定于感邪的轻重，一般来说，邪轻则病轻，邪重则病重。
疾病与病邪所中部位的关系：病邪侵犯人体，有在筋骨经脉者，有在脏腑者，病位不同，病证各异。
