1、子宫腺肌病及腺肌瘤：两者都可使子宫增大，但子宫腺肌病时子宫常呈均匀性增大，腺肌瘤则表现为子宫有局限性结节状突起，质地坚硬，有时在盆腔还可发现子宫内膜异位症的其他体征。且半数以上患者有渐进性痛经。超声检查有助于诊断，可发现宫体光点不均。但子宫肌瘤合并子宫腺肌病者也不少见，最后有待手术标本的病理学检查始能明确。
2、妊娠子宫：妊娠子宫质软，均匀性增大，患者有停经史，而肌瘤患者表现为月经量增多或不规则阴道流血，肌瘤除有变性外质地硬。故临床上凡是已婚育龄妇女伴子宫增大者，应仔细询问月经史，除外妊娠可能，必要时辅以妊娠试验，超声检查来鉴别。子宫肌瘤患者可以合并妊娠，也必须想到。
3、卵巢肿瘤：浆膜下子宫肌瘤与实质性卵巢肿瘤、肌瘤有变性者与囊性卵巢肿瘤或卵巢肿瘤与子宫发生粘连者，在鉴别诊断上有一定困难。详细询问病史，仔细妇科检查注意肿瘤与子宫关系，必要时可用子宫探针探测子宫腔深度及方向，辅以超声检查，多能鉴别，但有的须在手术中方能确诊。
4、子宫恶性肿瘤：宫腔内黏膜下肌瘤继发感染、出血、分泌物增多，易与子宫内膜癌混淆，超声检查、宫腔细胞学检查、诊断性刮宫作病理学检查，均有利于鉴别。黏膜下肌瘤脱出于阴道内伴感染，引起不规则阴道流血及恶臭排液时，易与外生型官颈癌混淆，仔细妇科检查不难鉴别，必要时可行病理学检查协助诊断。
5、子宫肥大症：患者也有月经过多，子宫增大，易与肌壁间小肌瘤或宫腔内黏膜下肌瘤混淆。但子宫肥大症患者子宫呈均匀性增大，一般在2个月妊娠大小左右，官腔形态正常，超声检查有助于鉴别。
6、子宫内翻：悬吊于阴道内的较大黏膜下肌瘤其形状与翻出的子宫很相似，但子宫内翻者除在阴道内触到包块外，盆腔内触不到子宫体，子宫探针检查时不能进入宫腔，有时在肿块表面可见到双输卵管开口。而黏膜下肌瘤者，手指伸入颈管可扪及瘤蒂。
7、子宫畸形：双子宫或残角子宫易误诊为子宫肌瘤，子宫输卵管碘油造影、超声检查或腹腔镜检查均可明确诊断。
8、盆腔炎性包块：盆腔炎性包块与子宫紧密粘连时可被误诊为子宫肌瘤。但患者往往有盆腔感染史，反复发作的下腹疼痛、发热等症状，肿块常为双侧性，较固定，有压痛，超声检查有助于鉴别。
9、子宫内膜间质肿瘤：子宫内膜间质肿瘤，起源于子宫内膜间质细胞，是属少见肿瘤。其临床表现、病理组织形态易与子宫其他疾病混淆而误诊、漏诊。
