通过雄激素进行治疗。雄激素对女性的子宫内膜异位症的痛经现象有显著的效果。普遍使用的药物有以下几种：甲基睾丸素5mg，患者每天可以口服每日2次；丙酸睾丸酮25mg，这种药物需要进行肌肉注射，每个星期可以注射2次，用药2～3个月后可以停药观察一段时间，而且每个月使用的药量不能高于300mg。
通过假孕方法进行治疗。也就是让患者服用一些避孕药，形成好像妊娠的人工闭经。普遍使用的药物主要有：乙酸孕酮、安宫黄体酮、甲地孕酮以及18甲基炔诺酮等，以上几种药物都可以有效治疗子宫内膜异位症。服用的药量比普通的避孕药量要高出4倍，而且同时还要配合服用雌激素，比如炔雌醇，可以控制患者的子宫内膜脱落出血。
通过保守的手术方法进行治疗。半死手术主要有开腹手术以及腹腔镜下手术。如果患者同时出现了子宫肌瘤的话，要一起进行切除。而痛经比较严重的患者，建议可以把骶前神经进行切除。在术过程中要尽量保留患者正常的卵巢组织。这种手术方法比较适合年龄小，长时间不孕的患者。
通过半保守手术进行治疗。这种手术主要是将患者的子宫和子宫内膜异位病灶进行切除，而卵巢功能将会保留。这种手术比较适合45岁以下，已经没有生育需求的患者，以及一些病灶范围比较广，无法保留生育能力的患者。
