大约有半数左右子宫内膜异位症的病人同时患有不育症。随着本病发病率的上升，子宫内膜异位症已经成为引起不育的主要原因。因此得了子宫内膜异位症，还有没有可能生育，便成了多数患者急于了解的问题。
子宫内膜异位症为什么会造成不育？到现在仍然是个谜。一般妇女不育主要有两方面的原因。其中较多见的是输卵管闭锁，阻塞了精子和卵子会合的通道；其次是由于内分泌失调而没有排卵功能。但这两方面的原因都解释不了子宫内膜异位症患者的不育。因为这类患者一般月经规律，有正常的排卵；且经过输卵管的检查，可见大多数卵管是通畅的，然而，在手术或腹腔镜检查的时候，往往可以可见输卵管周因包括伞端部分的粘连，因此人们趋向于把内膜异位症的不育，解释为粘连所引起的输卵管功能失常，而这些细微的功能改变可能影响到卵子的收集和运行，从而妨碍了受孕。此外，可能还有一些内分泌或免疫的因素。
为此对于年轻渴望生育的患者，当前治疗的目标，不仅在于消除散布在盆腔里的子宫内膜异位病变，同时还应尽可能恢复生育功能。应用激素类的药物和手术治疗内膜异位症，均可能改进患者的受孕能力。一般认为，经过假孕疗法，大约有30%病例经治疗后受孕。而经过一次前面提到的所谓保守性手术，术中尽可能切除内膜异位病变，同时将子宫、输卵管和卵巢周围的粘连一一松解，并仔细修复创面，以减少再次粘连，术后妊娠率可达50%。因此，对于这些年轻病例，如盆腔内有明显的囊肿或结节，多倾向于及时进行一次保守性的手术，给患者提供一个较高的受孕机会。虽然这种手术后的复发率都比较高，但对于一位迫切要求生育的妇女说来，还是值得尝试的。
