引起雌激素不足的最重要原因是卵巢功能低下。卵巢的功能有两个，产生卵子，产生雌激素。卵巢的功能下降，很直接的就会导致其产生的雌激素量的减少。
卵巢导致雌激素不足的常见原因：
卵巢物理性损害：如感染（幼儿患腮腺炎），抗癌治疗中的放疗，化疗。
卵巢切除：由于癌或其它孕因行手术切除。
卵巢早衰：在40岁以前月经停止卵巢，卵巢功能衰退叫卵巢早衰。首先表现月经停止来潮，分泌的雌激素不足，随之而来的就是机体衰老的一些表现，就像绝经一样，导致骨质疏松，牙齿脱落，神经系统的老化、记忆力减退，皮肤衰老表现皱褶、老年斑出现。另外还出现泌尿生殖道的萎缩，包括萎缩性的阴道炎、尿道炎等等。
其它因素：已明原因的卵巢供血障碍导致POF。也有人将POF误为无反应性卵巢，自身免疫病和原因不明的无卵泡三类。
