一般概括的讲，X线钡餐检查对胃大体形态，收缩功能，粘膜下或胃外压性病变以及病变定位较好，而胃镜检查可观察胃粘膜改变，病变大小，形态，特别是可以直接进行活检，取得病理学诊断，并且直观，假阴性和假阳性率极低。这是胃镜检查的独特优点。二者可结合应用，可以使优点互补，诊断率得到提高。
胃镜的优点：
1。直观：可以直接观察食管、胃、十二指肠球及球后、降部粘膜，并具有放大作用，对诊断更加方便有利。
2。准确：通过胃镜可以直接看到病变是否存在，色泽，大小形态，及周边粘膜的状态，并可以染色后进一步观察，并可以取活检，这是基他检查方法所不具备的。
3。安全：胃镜镜身较为柔软，光源为冷光源，无放射线辐射，应用安全，患者只有轻度恶心呕吐，绝对禁忌症明显减少，许多上消化道急症如呕血、黑便等均可进行急诊胃镜检查，保证了及时诊断，提高了治愈率。
4。诊治并行：目前胃镜检查已不再是单纯的诊断，而是诊断与治疗能够同时进行的先进手段，使以往许多需要剖腹探查手术的病人免除了开刀之苦，如电凝、电切、注射、激光和放置支架、碎石、取异物等。
5。资料完整可靠：可拍片，保持图像的原貌，报告单图文并茂，直观，便于会诊和复查。
与胃镜相比，X线胃肠透视检查的特点是：临床上应用历史更久，一般人认为检查时痛苦小，可以从整体上了解病变的部位，大小和与整个胃的关系，整体上可看清胃的形态，蠕动状态，病变部位较胃镜准确，但非直接征象，因此阳性率、准确率不如胃镜，且不能活检，不能同时进行治疗，还受检查者经验影响，易漏诊。因此止消化道疾病诊断中，胃镜检查已呈普及及增多趋势，已被大多数患者接受。在实际工作中，还需要医生仔细检查，决定是否需要X线胃肠透视还是胃镜检查。
